Wprowadzenie obowiązkowego Krajowego Systemu eFaktur będzie istotnie wpływać na korektę faktur. Zmienią się zasady wystawiania faktur korygujących.

Zasadą ogólną będzie to, że skorygowanie faktury wymagać wystawienia faktury korygującej za pośrednictwem KSeF. Nie będzie innego sposobu (innej drogi) na poprawienie faktury. Niezależnie od tego, jaki będzie charakter poprawek na fakturze.

Nie ma wprawdzie regulacji, które odnosiłyby się wprost do wystawiania faktur korygujących. Faktura korygująca również jest fakturą. To zaś powoduje, że takie faktury korygujące co do zasady powinny być wystawiane jako faktury ustrukturyzowane za pośrednictwem KSeF.

W tym kontekście trzeba powiedzieć, że faktura, która została wprowadzona do Krajowego Systemu eFaktur (wystawiona w KSeF) pozostanie w tym systemie.

Nawet, jeśli faktura ta została wystawiona przez pomyłkę, czy też nie na tego nabywcę, nie można jej wycofać z Krajowego Systemu eFaktur. Jedynym sposobem „wycofania się” z takiej faktury jest jej skorygowanie (zwykle skorygowanie do zera).

Nie będzie możliwości anulowania faktury, jej wycofania z systemu, czy jej podmienienia.

Przykładowo:

• Podatnik A wykonał usługę na rzecz podmiotu B. Przez pomyłkę osoby wystawiającej fakturę, faktura ustrukturyzowana została wystawiona na rzecz podmiotu C. Faktura ta została wprowadzona do KSeF. Nie można wycofać tej faktury z KSeF. Konieczne będzie jej skorygowanie w drodze faktury korygującej.
• Podatnik X sprzedał towary na rzecz podatnika Y. Przez pomyłkę na fakturze wskazano złą cenę jednostkową towaru. Fakturę trzeba skorygować za pośrednictwem KSeF. Nie ma możliwości jej podmiany.

To powoduje, że w praktyce może znacznie zwiększyć się liczba faktur korygujących w obrocie.